Tienes disponibles al menos dos buenos antivirus para dispositivos externos USB, como pendrives, discos duros, etc. Se puede usar como medida de prevención para cuando conectes el usb y para tener en el sistema y protegerlo de los dispositivos que se conecten.

MX One Antivirus — Panda USB Vaccine
Fuentes: antivirus para el usb

Los he probado los dos y funcionan perfectamente… me agradan los dos
yo tambien lo he probado y funciona vistad esta web tambien es de todo tipo de informacion y no para de poner noticias nuevas cada instante http://www.meenterodetodo.com
cuidaito con la web de meenterodetodo que tiene troyaos y spyware